ในปัจจุบันการวิเคราะห์เชิงระบบหรือโครงข่ายในสาขาวิชาเภสัชวิทยาและพิษวิทยาได้ถูกพัฒนาขึ้นมาอย่างรวดเร็วโดยเฉพาะสำหรับงานโอมิกส์และ high-throughput screening ที่ถูกทำมาประยุกต์ใช้ในการศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของตัวยาและสารพิษจากสิ่งแวดล้อม โดยการวิเคราะห์เภสัชวิทยาและพิษวิทยาเชิงระบบ ทำให้ทราบถึงกลไกสำคัญ คุณสมบัติและความเป็นไปได้ของปฏิกิริยาในเซลล์สิ่งมีชีวิตที่มีต่อสารพิษหรือตัวยานั้นๆ และจะมีการใช้การทดลองในระดับห้องปฏิบัติการเพื่อยืนยันการศึกษาต่อไป สำหรับห้องปฏิบัติการวิจัยเภสัชวิทยาได้นำการวิเคราะห์เภสัชวิทยาเชิงระบบมาใช้เพื่อศึกษากลไกของยาและสารเคมีต่างๆ ในสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะกลไกภายในเซลล์ที่ถูกควบคุมในระดับยีนส์หรือโปรตีนที่เกิดขึ้นจากการใช้ยาสมุนไพรไทยที่ประกอบด้วยสารสำคัญหลายชนิดและมีกลไกการออกฤทธิ์ร่วมกัน ซึ่งเป็นประโยชน์ในแง่ของการศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของยา และในแง่ของประเมินผลข้างเคียงของยาที่มีผลต่อสุขภาพในเบื้องต้น